时间回到昨天晚上，日卖电视台的著名主播水无怜奈因为自己家门外总是有人敲门，打开门却找不到人影，所以特意通过冲野洋子小姐邀请到知名侦探毛利小五郎帮忙解决。
柯南跟着毛利叔叔和小兰姐姐晚上住在水无怜奈家中，为了方便调查门外的可疑人影，柯南偷偷将口香糖窃听器粘在大门墙边，没想到却在第二天一早不小心掉下来黏在了水无怜奈的鞋底。
而柯南也因为这次意外得知了原来电视台主播水无怜奈竟然是代号为基尔的黑暗组织的人，并且知道了组织的计划——狙击呼声最高的限制药品进出口的国会议员。
柯南一路用追踪眼镜跟踪水无怜奈，阻止了她们在米花公园的狙击计划，黑衣组织并没有放弃而是计划在下午四点，议员的必经路上再次狙击。柯南联合fbi对任务的执行者基尔追踪夹击，基尔却在逃亡路上为了避开突然出现在马路上的小孩摔下摩托造成重伤。
由于fbi的长官詹姆斯和中岛院长是好友，曾经救过院长一命，所以重伤昏迷的基尔被fbi秘密送到米花中央医院请求院长进行急救，但是院长年纪已经大了，基尔的情况又比较紧急，院长并没有十足的把握，所以连忙联系了此时在横滨交流的七海千奈。
千奈一路风驰电掣上高速回到东京米花中央医院已经是离开afia的半个小时后了，千奈发现在华国自己安安分分做学术研究三年没出过什么大事，但是一回到霓虹却总是飙车赶着去救人的样子，霓虹尤其是东京的爆炸案、中毒案、车祸偷窃也太多了吧。
千奈怀着无语地心情到了医院的科研楼，为了保密，并没有用医院的公共手术室，而是用了科研楼的实验室，千奈一路带风走了进去，实验室门外明显地站着几个不一般的人，千奈来不及好奇就对着他们点了个头进了手术室。
院长只是年纪大了，拿手术刀可能不稳，没办法进行精细操作，但是手术经验比起千奈是要多得多的。在千奈到达手术室的时候，院长已经做了紧急止血工作并且处理了伤患身上的各处擦伤，千奈要做的就是检查伤患的大脑损伤情况，进行合理的手术治疗。
千奈发动死亡之眼一看，健康指数还在三十多，最严重的就是剧烈撞击造成严重脑震荡导致脑出血，并且颅骨也有一定损伤，不过现在这种程度的受伤哪怕没有[不死之手]，千奈也能轻松处理不会留下后遗症。
千奈清楚了具体情况后就放下心来，对着院长自信表明问题不大，可以处理。院长这才长舒口气，整个医院里，他最信任的医生就是千奈了，比那些手术经验十几年的医生还要信任。
因为是科研楼的实验室，所以并没有与手术室联通的准备室，院长给千奈指路说衣服和手套都在隔壁房间，让她去换了赶紧过来，千奈点头称是。
千奈刚出房间，就被一个金色短发的女人拉住胳膊，女人焦急问千奈：“你怎么出来了？她的情况很严重吗？她是我们追了很久的罪犯，拜托你一定要保住她的姓名。”
这种临到关头怀疑医生的人千奈见多了，她熟练地摆出冷酷的表情看了女人一眼，语气平淡却藏着巨大的傲气：“我的手术成功率是百分百。”
没管女人的表情，千奈转头就走到隔壁换上手术服和手套进入手术室，其实对于脑出血的病人来说，最好的手术时间是等到她的脑内出血停止之后再进行手术，防止开颅后脑内血呼呼一片看不清楚出血口。但是病人脑内出血停止后就会开始对大脑造成功能损伤，就像是三年前的松田警官一样，手术后六个小时脑水肿停止扩大了千奈才进行开颅手术，如今松田警官就是在大脑高度紧张的情况下手会控制不住发抖，再也做不了很精细的拆弹工作，只能退到搜查一课抓犯人。
但是既然女人都那么请求了，作为一个知法守法的热心市民，每抓捕一个罪犯作为普通市民的人安全就多了一分，所以千奈冒险现在就进行了开颅手术，千奈的手术速度本来就很快，在系统称号加成下变得更快了，她飞速在用医用棉将颅内出血沾掉，找到所有的出血口迅速止血，有[不死之手]的托底，千奈的手术就算冒险一点点也没关系，幸好千奈目前的手术操作跟得上她的手术理论，大概一个小时多，千奈就完成了这项在以前来说算是高难度的手术。
当伤口被彻底缝合之后，千奈宣布手术成功的那一刻，院长的脸上满是欣慰的笑容：“三年多没有亲自和你一起手术了，你的水平可是进步飞速啊！”
对着院长，千奈也没客气：“那是！我可是一直向着探索医学的尽头目标努力的，现在这些不过是刚刚开始。”千奈现在仅仅才西医精通，她还要继续研究医药学、生物医学、社会医学、流行医学、急症医学、法医学等等，最后达到西医全通，西医宗师等等更高的层次。除了西医，还有中华五十六个民族几千年传下来的中医学，生命是有限的，她梦想着在这有限的生命里探索无限的医学边界！
“好啊！”院长充满鼓励地拍了拍千奈的肩膀，“我们医院能够在你年轻的时候就慧眼识珠留到你这个人才真是我这一辈子做的最正确的决定了！”
千奈对着院长笑了笑，没有反驳，作为年少成名的天才，她也确实是骄傲的。
两人一起出去对着外边的那些人宣布了手术成功的事情，他们正在讨论在水无怜奈昏迷这段时间，将她藏在哪里。
“华国有句古话叫‘大隐隐于市’，我觉得就正常放在医院病房就好了，你们这群人出入科研楼说实话还是挺明显的。”
千奈早就想吐槽了，说实话院长电话打的急，只说了伤患在科研楼，没说具体位置，但是千奈一进科研楼就注意到了和研究院完全不同打扮不同气质的人，跟着他们就直接发现了手术室的位置。虽然现在可能是一时间没注意暴露，但是这也说明了这些人在这里是真的格格不入，千奈可不想因为他们给医院带来什么危险。
那几个主事fbi点了点头，算是认同了千奈的话，比起千奈，他们目前更相信的还是院长，所以他们又一次对千奈半威胁半劝告地要求保密之后就放千奈离开了。
千奈揉了揉酸疼的脖颈，一看时间已经快七点了，千奈立刻决定下班回家点外卖吃。
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话分两头，狙击国会议员的计划因为水无怜奈的失踪和fbi的搅局宣告失败，黑衣组织负责这个计划的琴酒和同伴们交流的过程中发现了电话传来“滋滋”的杂音，于是就在水无怜奈换下的软底鞋上发现了柯南偷偷安装的窃听器。
琴酒略一思索水无怜奈这两天的行程，立刻意识到这个窃听器应该是毛利小五郎偷偷安装的，恼怒之下琴酒带着手下来到毛利侦探事务所对面的楼顶，准备杀了这个搅局的侦探，但是这一切被赤井秀一，也就是两年前引起组织风声鹤唳的fbi卧底黑麦威士忌早一步猜到，提前埋伏在高楼后的高楼。
为了不让这件事牵连到毛利小五郎，将黑衣组织的视线转移到fbi身上，赤井秀一用它高超的狙击技术第一枪打掉窃听器引起琴酒注意，第二枪穿过琴酒的瞄准器精准擦过琴酒的半只眼睛，打中琴酒左脸颧骨。
赤井秀一强大的狙击准度和单枪匹马的自信让琴酒以为这一切都是fbi的阴谋，为了防止被伏击包围，琴酒迅速带着手下撤退。
但是琴酒的左眼却被子弹的火药烧伤，眼睛完全看不见了，琴酒左眼和颧骨血流不止，这对于一个左撇子的狙击手来说伤害是致命的，一时间情况非常不妙。
琴酒的手帕很快就被鲜血沾湿，伏特加焦急地用自己手帕帮忙按住伤口想要止血，但是却并没有什么用，“大哥，怎么办？你的眼睛”
“回基地。”琴酒冰冷的声音恨恨说道，这只可恶的，阴沟里偷生的老鼠，早晚有一天我要找到你，杀死你！
“我建议还是不要哦~”性感的女生从汽车后座传来，一个风情万种的美丽女人优雅坐在车后座，“离这里最近的基地要一个小时，光开车赶路的话你的眼睛怕是保不住了。”
“那怎么办！”伏特加气急败坏地低声怒吼，“不然去医院吧，我听说米花中央医院有个医术超高的医生。”
“不行，去医院会留下痕迹。”琴酒冷冷拒绝，“我们要低调行事知道吗！你查一下那个医生是谁，她家在哪里，我们直接去她家。”
“ok。”后座美艳女人一边说一边打开米花中央医院的官网介绍，“副院长、外科主任医师七海千奈，号称临床外科的黄金圣手，不死之手，应该就是她了。”
女人指尖飞舞，快速在电脑上输入一行行代码，“米花镇二号街27号的别墅是她名下的房产，距离这里很近，大概二十分钟能到。”女人说到这里抬手看了看表，“现在是六点快半，她应该已经下班了，可以去看看。”
在女人说出地址的时候，伏特加就调转方向盘，径直开到千奈家别墅门口，本来伏特加想直接撬开门锁的，但是却发现一个中年妇女正在玻璃花房内浇水，几人对视一眼，贝尔摩德主动上前按响了门铃，假装是千奈的客人，朋友受伤了，来找她帮忙。
等到佐佐木女士一带他们进入客厅，贝尔摩德立刻一个手刀敲晕佐佐木女士，琴酒举枪就要杀死佐佐木女士，贝尔摩德连忙挡住他的枪口：“不知道她什么时候回来，医生对血腥味最明显了。”