只是万万没想到，在中忍考试这个重要的场合上，大蛇丸竟对木叶发起了突袭！
大蛇丸袭击木叶的目的有很多，其中之一就是想要蛊惑佐助，大蛇丸的独门忍术不尸转生可以更换躯体，他将佐助视作了自己的转生容器。
不过就算没有佐助，大蛇丸依旧会联合砂忍袭击木叶，这个蛇一样的男人，脑子里总是充斥着很多疯狂的想法，虽然他与砂忍表面上联手了，但他却在私底下杀害了四代风影，又假扮风影的模样参加木叶的中忍考试。
在听说“宇智波末裔已经离开木叶”这件事之后，大蛇丸心里感到了一阵惋惜，转生容器竟然就这么没了，可这并不影响他继续执行自己的木叶崩溃计划。
他甚至以秽土转生之术召唤了初代火影和二代火影出来作战，可惜最终却被三代火影猿飞日斩以尸鬼封尽之术封印了两位先代火影的灵魂，同时大蛇丸也遭受到了重创。
可三代目也为此而付出了生命的代价，这个慈祥的老人或许并不是个完美的政治领导，但他却是木叶当之无愧的精神领袖，前几任火影早已成为了历史，三代火影的执政时间太长了，村子里的两代人都是在他的看护下成长起来的，他的死对木叶的忍者来说是一桩沉重的打击。
新上任的五代目火影是三代目的弟子纲手，同时她也是木叶的创始人、初代火影千手柱间的后代。
有了新的火影，木叶的混乱逐渐平息了下来，只不过纲手也有头痛的地方，她的权力受到了两位顾问以及团藏的掣肘，每天还要处理一大堆的文件，再也没时间去输点小钱钱了……
佐助被列为叛忍后，最担心他的可能就是宇智波鼬了。三代已经死了，知道当年那件事的人只剩下那几个老家伙，鼬曾威胁过团藏，如果敢伤害佐助，他就会把村子的情报出卖给敌国。
然而这只能是个威胁而已，在他将这个威胁说出口的时候，木叶恐怕就在防备这种事了，况且鼬离村多年，曾经在根部服役的时间也并不长，以木叶高层对宇智波的防备，他实际上根本接触不到太机密的情报。
现在佐助是自己离开的，而且他应该还好好的活着，木叶也不算违反约定，鼬如果真的翻脸了，只会让情况变得更糟糕，万一触怒了村子高层，他们非要把佐助抓回来杀掉怎么办？
就算木叶真的伤害了佐助，鼬扪心自问，自己真的会为了弟弟而损害村子的利益么？这是个两难的抉择，幸好情况还没有到那种地步，他不必再做一次二选一的选择题。
“当务之急，还是应该先找到佐助的踪迹再说。”鼬冷静的想着。
他心里十分担心佐助，他知道佐助在很小的时候就拥有强大的力量，几年前他不放心佐助一个人留在村里，曾用乌鸦暗戳戳的关注着心爱的弟弟，然后乌鸦很快就被发现了，再然后他就眼睁睁的看到佐助|虐|杀了好几个木叶忍者，并嫁祸到了那只乌鸦的身上。
鼬当时很是不安，佐助的能力明显超出了他的预期，而且性情还那么残忍……
宇智波一族的憎恨越强烈，力量也就越强大，鼬猜测佐助的内心必定充满了极端的恨意，所以才拥有了不同寻常的力量。
只是鼬一直都希望佐助日后能成为村子的英雄，让宇智波永远都是木叶的宇智波，可一旦杀害同村忍者的事情被曝光，佐助很可能会永远失去这个机会，所以鼬当时想方设法的将那几个被害者的死亡线索扯到了自己的身上，让村子以为这件事是自己干的。
鼬因此不再被村子信任，虽然他本来就是不被信任的，只是此后连唯一信任他的三代都开始怀疑他了。
可鼬不得不为弟弟承担这种责任，佐助的突然离村与他诡异的性格变化都已经严重脱离了鼬的计划，为了让佐助回归正途、也为了防止情况进一步恶化，鼬已经考虑再见到佐助时，是否要对他使用别天神。
别天神是宇智波止水的万花筒瞳术，可以悄无声息的扭曲一个人的意志，本就是鼬为佐助准备的后手，万一灭族的真相被揭露，为了防止佐助走上与木叶对立的歧途，可以用别天神修改他的思想意志，让他永远充当村子的守护者。
可鼬却觉得现在就有必要使用别天神了，佐助几年前就敢滥杀同村忍者，这种性子必须得到及时的纠正，否则后果不堪设想！
虽然被强行扭曲意志是一件很冷酷的事，但这一切都是为了他好！
此时的鼬从未想过，自己终其一生都没能再见佐助一面。